建有洁净用房的食品工厂厂区内的建筑物的位置应满足食品的生产工艺的需要，划分生活区，生产区中应明确区分洁净生产区，一般生产区和非食品处理区。
生产过程中发生空气污染较严重的建筑，应建在厂区内常年多风向的下风侧。
物品存放有序，生产所用手推车、原料和清洗工具等，在未使用时应存放在适当的区域，同时将相应区域带分类标识；
在净化车间内禁止使用非净化用品，如有必要使用，应将非净化用品置于回风附近；
检验后的成品应整齐地堆放在指定区域，用标识带做好标识，统一由出货缓冲区送出车间。
食品净化车间的日常维护
1. 注意车间周围的环境卫生，防止粉尘等物质;
2. 注意检查一次效率和中间效率的压差。当压差大于初始压差的2倍时，应清洗滤布;
3.净化车间清洗一、中滤布时，选用清洗剂而不是洗衣粉。
食品厂净化车间在使用一段时间后，其内部的设备和仪器上可能会残留一些或污染物，因此定期对食品厂净化车间进行清洗是非常重要的。食品厂净化车间本身就是一个比较特殊的场所，它在清洗时所适用的清洁剂或剂不得对设备、物料、成品产生污染。另外，食品厂净化车间，还要定期更换剂种类，防止产生耐药性。