实验室净化工程等级设计也很关键，一般的无菌室实验室洁净度等级都是万级，一般普通实验室则大范围十万级~万级的布局设计。生物实验室、阳性对照实验室以及微生物培养实验室则需按照静态百级的洁净室标准进行设计、施工。
万级净化主要靠洁净的气流不断稀释室内的空气,将室内的污染逐渐排出,来实现洁净效果。室内的气流是以不均匀的速度呈不平行流动,拌有回流或涡流,不同等级的无尘室,主要是依靠单位时间内所送风量的不同来实现。 目前有十万级和三十万级两种标准。
万级无菌室就是无菌室室内空气经处理，室内每立方米空间的微粒数不大于一万个，十万级无菌室即室内每立方米空间的微粒数不大于十一万个。P2实验室是指生物实验室等级的一个分类。在现在各类实验室当中，P2实验室是使用更为广泛的生物等级实验室。其等级有 P1、P2、P3、P4，按照实验室的性质要求来取舍相应的等级。
万级无菌室有足够的存储空间摆放物品以方便使用。在实验室工作区域处还有供长期使用的存储空间。在实验室的工作区域处应有存放个人衣物的条件。在实验室所有的建筑内配备高压蒸汽自净器，并按期检查和验证，以保证符合要求。